近日，蘭州大(dà)學第一醫院與真邁生物(wù)在BMC Medical Genomics雜(zá)志合作發表了(le)題爲“Fraternal twins with Phelan-McDermid syndrome not involving the SHANK3 gene: case report and literature review”的(de)研究論文。研究展示了(le)一項基于真邁生物(wù)GenoCare測序平台開展的(de)染色體疾病Phelan-McDermid綜合征案例分(fēn)析，通(tōng)過單分(fēn)子測序發現了(le)與該染色體異常相關的(de)新的(de)緻病基因。

→論文鏈接

該研究中的(de)病例是一對(duì)7歲異卵雙胞胎，二人(rén)均具有智力殘疾、嚴重語言發展障礙、行爲異常等臨床表現，在5歲時(shí)診斷爲Phelan-McDermid綜合征。最初采用(yòng)的(de)遺傳分(fēn)析手段是串聯質譜和(hé)核型分(fēn)析，但都沒有得(de)到任何可(kě)靠的(de)結果，随後進行CNV-seq檢測發現在22号染色體的(de)22q13.31-22q13.33區(qū)間存在一段雜(zá)合的(de)缺失，男(nán)孩和(hé)女(nǚ)孩的(de)染色體分(fēn)别存在一段6.36Mb和(hé)6.34Mb的(de)缺失區(qū)域。

Phelan-McDermid綜合征又名22q13缺失綜合征，主要的(de)臨床表現包括智力殘疾、全面發展延遲、肌張力低下(xià)、自閉症譜系障礙、顱面部畸形等，是由于染色體22q13區(qū)域缺失而導緻的(de)一種染色體缺失綜合征。SHANK3基因被認爲是與該病最密切相關的(de)緻病基因。 

爲獲得(de)更精确的(de)染色體異常情況，本研究采用(yòng)單分(fēn)子基因測序平台GenoCare 1600對(duì)這(zhè)兩名患者以及他(tā)們的(de)父母進行染色體異常的(de)檢測，采集外周血後進行測序。測序結果顯示，兩名患者具有一個(gè)完全相同的(de)缺失位點，是一段6Mb的(de)雜(zá)合缺失（圖1），而他(tā)們的(de)父母在該位點則是正常的(de)，表明(míng)這(zhè)是一個(gè)新發突變（de novo mutation）。在這(zhè)6Mb的(de)缺失區(qū)域中，包含了(le)45個(gè)蛋白編碼基因但卻不包括SHANK3基因。此外，在其母親的(de)同一條染色體上檢測到了(le)一個(gè)小的(de)0.6Mb的(de)缺失（圖2）。

圖2：GenoCare 1600檢測結果（患兒(ér)母親）

該研究中，兩名患兒(ér)的(de)染色體異常均源于胚胎，可(kě)能以嵌合的(de)形式存在，通(tōng)過傳統的(de)方法無法很好地進行産前診斷，而已有的(de)一些研究顯示，基于單分(fēn)子基因測序儀的(de)檢測體系對(duì)低至20%的(de)胚胎異常嵌合可(kě)成功檢出，因此更高(gāo)精度的(de)檢測技術有望在産前實現胚胎的(de)染色體疾病檢測，使得(de)染色體疾病可(kě)以更早的(de)被發現，早發現早應對(duì)早治療。

相比于核型分(fēn)析、CMA等傳統檢測手段，單分(fēn)子基因測序平台GenoCare 1600進行分(fēn)析能獲得(de)更精确的(de)檢測結果，更快(kuài)速地發現遺傳病相關的(de)緻病位點，輔助診斷與治療。