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真邁生物(wù)聯合達普生物(wù)發布腫瘤單細胞轉錄組評測數據
時(shí)間:
2022-06-10
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近日,真邁生物(wù)和(hé)達普生物(wù)強強合作,聯合發布GenoLab M基因測序儀檢測臨床腫瘤單細胞轉錄組樣本的(de)評測數據。


本次測評基于達普Galaxy星海單細胞測序建庫系統完成兩類臨床腫瘤單細胞的(de)轉錄組文庫制備,制備好的(de)文庫由達普生物(wù)分(fēn)别在GenoLab M和(hé)NovaSeq 6000上進行測序,測序數據分(fēn)析表明(míng),GenoLab M 表現優異,與對(duì)比平台檢測出的(de)單細胞UMI水(shuǐ)平、細胞聚類、同基因表達量結果高(gāo)度一緻。


01 實驗方案

1. 測試用(yòng)樣本:兩種不同腫瘤組織制備而成的(de)單細胞懸濁液;

2. 單細胞建庫系統:文庫制備試劑:星海單細胞 3' 轉錄組測序建庫試劑盒(Galaxy Single Cell 3' mRNA Kit v1.0);文庫制備平台:星海單細胞建庫系統(Galaxy Single Cell  Analysis System);

3. 測試平台:GenoLab M、NovaSeq 6000;

4. 測試實驗:使用(yòng)達普生物(wù)星海單細胞建庫系統與3' 轉錄組測序建庫試劑盒對(duì)兩種不同腫瘤組織解離後得(de)到單細胞懸濁液進行單細胞轉錄組測序文庫制備(下(xià)文簡稱S1、S2)。構建好的(de)文庫分(fēn)别在GenoLab M、NovaSeq 6000測序平台上進行測序。

真邁生物(wù)聯合達普生物(wù)發布腫瘤單細胞轉錄組評測數據



02 測試結果

GenoLab M 測試結果與對(duì)比平台一緻性高(gāo)

對(duì)GenoLab M和(hé)NovaSeq 6000測序數據進行分(fēn)析,S1和(hé)S2樣本在兩平台檢測細胞UMI水(shuǐ)平、細胞聚類、同基因的(de)表達量等結果高(gāo)度一緻(圖1~3)。

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1 細胞UMI分(fēn)析結果

(左:S1;右:S2)


●Single-cell clustering 對(duì)比

 S1:

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 S2:

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圖2 細胞聚類分(fēn)析


●Barcode assignment 對(duì)比

    S1:

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    S2:

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圖3 同一cell barcode 的(de) UMI及基因數對(duì)比分(fēn)析的(de)表達量


03 産品介紹

達普Galaxy星海單細胞建庫系統

1性能優:可(kě)一次性完成數百至數萬個(gè)細胞的(de)分(fēn)離,基因檢測靈敏度高(gāo);
2)上樣活:1-4 通(tōng)道,可(kě)靈活選擇樣本數及細胞數量,方便快(kuài)捷;
3)兼容好:文庫兼容 GenoLab M 和(hé) NovaSeq 6000 等測序平台;
4)分(fēn)析全:自主開發的(de)StarScope 生分(fēn)析軟件可(kě)完成分(fēn)析報告的(de)輸出;
5)流程活:可(kě)接駁下(xià)遊流程 ,如單液滴分(fēn)選。


04 總結

基于達普Galaxy星海單細胞建庫系統構建兩類腫瘤單細胞轉錄組文庫在GenoLab M進行測序,數據分(fēn)析結果表明(míng)細胞UMI水(shuǐ)平、細胞聚類、同基因的(de)表達量與對(duì)比平台一緻性高(gāo),能夠極佳地滿足科研以及臨床對(duì)于單細胞測序需求。


GenoLab M基因測序平台與達普Galaxy星海單細胞建庫系統均爲全流程自主研發的(de)國産化(huà)平台,利用(yòng)雙方平台靈活上樣、高(gāo)性價比等優勢,能大(dà)大(dà)縮短單細胞測序周期,全面提高(gāo)效率并降低測序成本,爲臨床應用(yòng)提供從單細胞到數據結果的(de)全流程解決方案。同時(shí)助力單細胞多(duō)組學科研普及化(huà)和(hé)轉化(huà)單細胞多(duō)組學研究在臨床中的(de)應用(yòng)。在未來(lái),雙方将進一步深化(huà)合作,解決單細胞測序在臨床與醫學轉化(huà)中的(de)“卡脖子”技術,爲科研用(yòng)戶及臨床工作者提供高(gāo)質量、高(gāo)性價比的(de)單細胞測序全流程解決方案。

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