9月(yuè)15日，真邁生物(wù)與序祯達生物(wù)、UST共同簽署協議(yì)，正式達成戰略合作。根據協議(yì)，序祯達生物(wù)将采用(yòng)UST的(de)TELL-Seq關聯長(cháng)讀長(cháng)二代測序技術，并通(tōng)過真邁生物(wù)的(de)GenoLab M高(gāo)通(tōng)量基因測序平台，推出經濟可(kě)及的(de)長(cháng)讀長(cháng)測序解決方案，爲廣大(dà)合作夥伴提供高(gāo)品質的(de)檢測分(fēn)析服務。作爲此次戰略合作的(de)第一個(gè)重量級成果，三方聯合推出的(de)「細菌基因組完成圖-NGS躍級版」今日發布。
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細菌基因組完成圖-NGS躍級版
組裝細菌完整基因組是現代微生物(wù)研究的(de)重要手段。利用(yòng)細菌基因組完成圖可(kě)以更好地研究重要基因功能、鑒定未知功能基因以及比較物(wù)種間的(de)進化(huà)關系，這(zhè)在傳染性疾病的(de)研究、預防與治療，環境微生物(wù)研究及疫苗和(hé)抗生物(wù)等的(de)研究開發中都發揮著(zhe)重要作用(yòng)。
序祯達生物(wù)采用(yòng)UST的(de)TELL-Seq關聯長(cháng)讀長(cháng)二代測序技術，結合真邁生物(wù)的(de)GenoLab M高(gāo)通(tōng)量基因測序平台，打造出一款通(tōng)過二代測序平台即能接近三代組裝效果的(de)全新産品——細菌基因組完成圖-NGS躍級版。
丨長(cháng)讀長(cháng)二代測序技術讓細菌基因組完成圖繪制觸手可(kě)及
細菌基因組完成圖-NGS躍級版采用(yòng)了(le)關聯長(cháng)讀長(cháng)二代測序技術——TELL-Seq，該技術通(tōng)過轉座酶對(duì)來(lái)自同一條長(cháng)DNA的(de)小片段進行特定标記，利用(yòng)标記對(duì)短讀長(cháng)序列進行拼接，讓二代測序的(de)短讀長(cháng)數據産生超長(cháng)讀長(cháng)測序效果，等價讀長(cháng)達20 kb-200 kb。經過創新開發的(de)生信算(suàn)法，組裝的(de)平均效果爲contig(>10kb)：1-10個(gè)；N50：2-5Mb（與基因組大(dà)小關聯）。
該技術不僅可(kě)用(yòng)于微生物(wù)de novo測序（菌種鑒定），還(hái)可(kě)應用(yòng)于基因組單倍體分(fēn)型（Phasing）、基因組結構變異、新物(wù)種全基因組de novo組裝等多(duō)個(gè)方向。
丨細菌基因組完成圖-NGS躍級版，揭示細菌基因組完整面貌
細菌基因組完成圖-NGS躍級版通(tōng)過基于TELL-Seq的(de)二代測序技術以真邁生物(wù)的(de)GenoLab M爲載體，對(duì)細菌基因組進行測序，實現高(gāo)性價比的(de)基因組完成圖組裝，獲得(de)高(gāo)準确度的(de)基因組信息。
丨卓越效果，眼見爲實
TELL-Seq技術的(de)測序數據可(kě)以組裝出接近完美(měi)的(de)細菌基因組
樣本要求及檢測周期：
送樣要求：≥50ng，片段長(cháng)度＞20kb，未經反複凍融，無降解，無污染
運輸要求：-80℃保存，幹冰運輸
檢測周期：最短3周（收到樣本至交付組裝結果）
交付結果：DNA質檢報告、測序下(xià)機原始數據、組裝結果
關于GenoLab M
GenoLab M是一款精準、高(gāo)效、靈活、開放的(de)桌面型高(gāo)通(tōng)量基因測序平台，其采用(yòng)基于芯片擴增的(de)表面熒光(guāng)測序技術SURFSeq對(duì)堿基的(de)熒光(guāng)信号進行識别，實現邊合成邊測序。GenoLab M可(kě)以兼容目前市面上主流的(de)NGS文庫制備産品和(hé)數據分(fēn)析流程。
相較于目前市場(chǎng)上的(de)同類競品，GenoLab M在擁有雙芯片平台的(de)基礎上，還(hái)支持'滾動上機'模式，“滾動上機”是指GenoLab M在運行單側芯片平台測序時(shí)，用(yòng)戶可(kě)根據實際實驗需求随時(shí)啓動空閑芯片平台的(de)測試工作，“雙芯片平台+滾動上機模式”極大(dà)地提高(gāo)了(le)GenoLab M的(de)檢測靈活性，爲用(yòng)戶帶來(lái)了(le)優秀的(de)使用(yòng)體驗。
參考文獻：
1. Chen Z, Pham L, Wu TC, et al. Ultra-low input single tube linked-read library method enables short-read second-generation sequencing systems to generate highly accurate and economical long-range sequencing information routinely. Genome Res. 2020;30(6):898-909. doi: 10.1101/gr.260380.119.
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