2023年8月(yuè)，真邁生物(wù)用(yòng)戶俄羅斯科學院托木(mù)斯克國家研究醫學中心癌症研究所的(de)Anastasia Frolova博士在國際刊物(wù)Bulletin of Experimental Biology and Medicine在線發表題爲“Preparation of a Single-Cell Suspension from Tumor Biopsy Samples for Single-Cell RNA Sequencing”的(de)研究成果，該研究團隊開發了(le)多(duō)種腫瘤活檢标本的(de)解離方法，均成功制備了(le)高(gāo)于80%活力的(de)細胞懸浮液，通(tōng)過GenoLab M測序儀進行scRNA-seq後，最終确定了(le)樣品制備的(de)最佳方式爲：機械解離後，添加DNAase I的(de)膠原酶/透明(míng)質酸酶混合物(wù)一起孵育60分(fēn)鐘(zhōng)。該研究優化(huà)了(le)腫瘤活檢組織制備單細胞懸浮液以進行單細胞RNA測序的(de)方法。

腫瘤具有顯著的(de)細胞異質性，涉及到多(duō)種細胞類型，了(le)解其細胞間相互作用(yòng)對(duì)疾病治療至關重要。單細胞轉錄組測序(scRNA-seq)是在單個(gè)細胞水(shuǐ)平進行高(gāo)通(tōng)量轉錄組測序的(de)一項新技術，能夠有效解決細胞異質性以及組織轉錄組測序（bulk RNA-seq）被掩蓋的(de)細胞群内轉錄組異質性難題。近年來(lái)，scRNA-seq提供了(le)研究腫瘤細胞生物(wù)學特性和(hé)基因表達的(de)新視角，但隻有制備出高(gāo)質量的(de)單細胞懸浮液樣本，才能開展scRNA-seq研究。

該研究優化(huà)腫瘤活檢樣本制備單細胞懸浮液的(de)方法。他(tā)們通(tōng)過機械離解和(hé)酶解離的(de)組合，特别是機械離解結合膠原酶/透明(míng)質酸酶混合物(wù)的(de)使用(yòng)，最終獲得(de)了(le)至少80%存活率的(de)單細胞懸浮液。在獲得(de)的(de)懸浮液樣本中，進行了(le)scRNA-seq分(fēn)析，成功鑒定了(le)不同細胞類型，包括腫瘤細胞、單核細胞、T細胞、B細胞、樹突狀細胞和(hé)自然殺傷細胞。圖1是詳細的(de)scRNA-seq測序流程，從獲得(de)腫瘤活檢組織開始到scRNA-seq測序獲得(de)不同的(de)細胞亞群的(de)全過程。

該研究爲scRNA-seq提供了(le)可(kě)靠的(de)樣本制備方法，能夠獲得(de)高(gāo)質量、高(gāo)存活率的(de)單細胞懸浮液。這(zhè)種方法的(de)成功爲未來(lái)腫瘤生物(wù)學研究提供了(le)重要工具，有望幫助科學家更全面地理(lǐ)解腫瘤細胞之間的(de)交互作用(yòng)和(hé)基因表達差異，爲個(gè)性化(huà)醫療和(hé)腫瘤治療策略的(de)設定提供支持。

Frolova A A, Gerashchenko T S, Patysheva M R, et al. Preparation of a Single-Cell Suspension from Tumor Biopsy Samples for Single-Cell RNA Sequencing[J]. Bulletin of Experimental Biology and Medicine, 2023, 175(4): 519-523.