測試數據顯著表明(míng),SURFSeq 5000測序平台和(hé)百創S1000在空間聚類上展現出良好的(de)性能表現。
在針對(duì)中腦(nǎo)的(de)單細胞級空間聚類分(fēn)析中,即便在數據不飽和(hé)的(de)條件下(xià),使用(yòng)SURFSeq 5000測序平台進行測序仍然展現出卓越的(de)解析度,這(zhè)一結果再次驗證了(le)SURFSeq 5000測序平台和(hé)百創S1000兼容性方面的(de)出色性能。
爲了(le)深入驗證百創S1000在更高(gāo)測序數據量上的(de)性能表現,研究人(rén)員(yuán)随機選取了(le)BMK_ST_9(鼠腦(nǎo))樣本在SURFSeq 5000測序平台上進行了(le)數據加測(Nnumber of Rreads:5,094,460,583)。經過詳盡分(fēn)析發現,無論在任何分(fēn)辨率下(xià),這(zhè)些數據均展現出卓越的(de)空間解析能力,進一步确認了(le)SURFSeq 5000測序平台與百創S1000卓越的(de)兼容性和(hé)性能表現。
百創S1000基于SURFSeq 5000測序平台的(de)多(duō)級分(fēn)辨率統計表
百創S1000基于SURFSeq 5000測序平台的(de)多(duō)級分(fēn)辨率部分(fēn)聚類圖
基于原片無錯高(gāo)清H&E+原片無錯熒光(guāng)+原片高(gāo)通(tōng)量測序,“三片合一”對(duì)樣本數據進行了(le)細胞分(fēn)割分(fēn)析,一共切出了(le)68,279個(gè)細胞,單細胞級分(fēn)辨率下(xià)中位基因數高(gāo)達2,625,中位UMI數達6,631,全局下(xià)聚類得(de)到28類cluster,數據表現處于領先水(shuǐ)平。
本次測試展示了(le)真邁生物(wù)SURFSeq 5000高(gāo)通(tōng)量基因測序平台與百邁客生物(wù)百創S1000空間轉錄組學産品組合應用(yòng)的(de)優秀性能。真邁生物(wù)期待與行業内合作夥伴共同打造基因測序平台應用(yòng)生态聯盟,充分(fēn)發揮和(hé)利用(yòng)各方優勢,爲廣大(dà)用(yòng)戶提供全流程、最全面的(de)解決方案。
SURFSeq 5000高(gāo)通(tōng)量基因測序平台應用(yòng)廣泛,速度快(kuài),質量優,成本省。它以桌面儀器成本、小樣本數量開機成本實現了(le)與大(dà)型機器相媲美(měi)的(de)高(gāo)通(tōng)量測序價格。真邁生物(wù)緻力于持續滿足行業對(duì)測序優化(huà)的(de)需求,與合作夥伴深度合作,爲前沿科研探索和(hé)精準醫療提供強有力的(de)支持。
創S系列空間轉錄學芯片已正式發布三款:百創S1000(per spot2.5μm,分(fēn)辨率4.8μm,區(qū)域6.8mm*6.8mm),百創S2000(per spot2.5μm,分(fēn)辨率4.8μm,區(qū)域11mm*11mm、15mm*20mm)以及最新的(de)百創S3000(per spot2.5μm,分(fēn)辨率3.5μm,區(qū)域6.8mm*6.8mm),相較于現在廣受市場(chǎng)認可(kě)與好評的(de)百創S1000轉錄組學芯片,百創S3000捕獲位點數提升近2倍,分(fēn)辨率同樣提升近2倍,相同的(de)測序飽和(hé)度下(xià),單細胞級别分(fēn)辨率下(xià)中位UMI提升了(le)30%~70%,中位基因數提升30%-60%。并基于此,開發出了(le)百創自己的(de)專利技術,可(kě)以通(tōng)過完全無錯的(de)原片高(gāo)清明(míng)場(chǎng)圖像 + 與明(míng)場(chǎng)圖像完全對(duì)齊的(de)原片熒光(guāng)圖像 + 原片高(gāo)通(tōng)量測序,“三片合一”進行精準的(de)細胞分(fēn)割,爲科研工作者提供了(le)前所未有的(de)研究視角。