QIAGEN選用(yòng)QIAseq Targeted DNA Panel基于真邁生物(wù)測序平台進行測試,測試結果顯示On target rate 90%,均一性表現佳,突變位點均可(kě)檢出,真邁生物(wù)兩個(gè)測序平台VAF(%) 突變的(de)檢出結果也(yě)具有很高(gāo)的(de)一緻性。擴增子文庫中的(de)common sequence區(qū)域測序質量符合預期。
SURFSeq 5000與GenoLab M VAF(%) 相關性比較
真邁生物(wù)SURFSeq 5000測試質量Q40數據已達到90%,錯誤率低至萬分(fēn)之五(0.05%),數據質量業界領先,且測序成本更低,和(hé)行業同級别測序儀相比具有顯著優勢;GenoLab M數據質量優異,通(tōng)量靈活(18Gb-300Gb),用(yòng)戶可(kě)根據相關應用(yòng)場(chǎng)景自由選擇合适通(tōng)量。
QIAGEN SPE(基于單端特異性引物(wù)延伸技術)靶向測序方案技術能夠實現在一個(gè)反應管中最多(duō)兼容2萬條特異性引物(wù)的(de)PCR反應,而特異性依舊(jiù)可(kě)高(gāo)達90%以上。僅需一條引物(wù)結合到靶向區(qū)域即可(kě)擴增,整體擴增均一性指标 (Uniformity) 超過97%。
QIAseq FX DNA Library Kit制備的(de)WGS文庫基于真邁生物(wù)測序平台測序的(de)覆蓋度、均一度等指标與其他(tā)主流平台相當。QIAseq FX支持20 pg-1 μg的(de)廣泛樣本起始量,無需片段化(huà)和(hé)接頭連接反應之間進行純化(huà),能夠不受基因序列影(yǐng)響,制備出具有最低G/C偏好性的(de)基因文庫,特别适用(yòng)于具有高(gāo)度複雜(zá)性的(de)各種基因組。
100 bp 區(qū)域的(de)基因組覆蓋率(%)
真邁測序平台檢測Small RNA的(de)性能表現一緻
Small RNA文庫僅需SE75即可(kě)完成測序,但是考慮測序成本和(hé)便利性,一般選用(yòng)PE150上機。本次測試選擇了(le)PE150的(de)測序方案,數據則截取R1 75bp進行分(fēn)析,測試結果顯示真邁生物(wù)測序平台miRNA檢出比例與其他(tā)主流平台高(gāo)度一緻,在真邁生物(wù)不同測序平台間,miRNA檢出比例與表達量仍具有較高(gāo)的(de)一緻性。
SURFSeq 5000與GenoLab M 檢測miRNA的(de)一緻性比較
QIAseq miRNA Library Kit 是一款專爲miRNA等小RNA測序分(fēn)析設計的(de)NGS解決方案,獨特的(de)寡核苷酸處理(lǐ)技術極大(dà)程度降低了(le)文庫構建過程中接頭二聚體及其他(tā)“污染性”RNA(如hY4 RNA)的(de)存在,無需凝膠電泳、割膠以及回收等一系列繁瑣步驟,最低起始量僅需1ng總RNA。
基于QIAGEN CLC Genomics Workbench Premium的(de)LightSpeed模塊,可(kě)助力真邁生物(wù)相關用(yòng)戶以更短的(de)運行時(shí)間進行高(gāo)性價比的(de)全基因組測序(WGS)二級分(fēn)析。QCI Interpret是一個(gè)完全可(kě)定制的(de)變異解讀方案,爲腫瘤和(hé)遺傳病應用(yòng)NGS檢測的(de)變異進行注釋和(hé)評級,目前已解讀超過300萬份報告。
QIAGEN生物(wù)信息解讀完整方案
此次合作測試,真邁生物(wù)測序平台與QIAGEN試劑盒表現出高(gāo)度的(de)适配性。未來(lái),真邁生物(wù)與QIAGEN将深化(huà)合作,發揮雙方在高(gāo)通(tōng)量基因測序領域的(de)優勢,爲全球臨床及科研用(yòng)戶提供精準高(gāo)效的(de)測序平台、生物(wù)試劑,以及強大(dà)的(de)數據分(fēn)析與解讀系統,持續拓寬測序應用(yòng)場(chǎng)景,爲前沿科研探索和(hé)精準醫療提供強大(dà)支持,共同促進産業創新發展。
*真邁生物(wù)基因測序平台
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