◆ 快(kuài):9小時(shí)即可(kě)完成核酸樣本的(de)建庫及SE75 Dual Index測序
◆ 準:在超高(gāo)人(rén)源核酸背景下(xià),含量低至0.01%的(de)細菌與病毒均可(kě)準确檢出
◆ 穩:10 ng~1000 ng的(de)核酸均可(kě)實現成功建庫、穩定測序
【 測試方案 】
樣本組成:爲更好地模拟感染樣本真實組成,使用(yòng)293細胞 Total RNA 模拟人(rén)源核酸背景,按0.1%和(hé)0.01%的(de)比例摻入等量細菌(Sau1)和(hé)病毒(PEDV2、PRRSV3)的(de)RNA。
表1. 樣本組成
建庫試劑盒:TruePrep® RNA Library Prep Kit(TR501-503)
測試平台:FASTASeq 300、NovaSeq 6000
分(fēn)析策略:每個(gè)樣本抽取SE75 20M reads用(yòng)于後續分(fēn)析
【 測試結果 】
■ FASTASeq 300測序數據質量表現優異,平均Q30>93%。
圖1. 不同樣本在FASTASeq 300和(hé)NovaSeq 6000平台測序質量表現
■ FASTASeq 300病原微生物(wù)檢出性能優異,與NovaSeq 6000檢出水(shuǐ)平相當。
圖2. 0.1%~0.01%細菌(Sau)檢出水(shuǐ)平
圖3. 0.1%~0.01%病毒(PEDV和(hé)PRRSV)檢出水(shuǐ)平
【 産品介紹 】
建庫試劑盒:諾唯贊重磅推出轉座酶RNA建庫試劑盒——TruePrep RNA Library Prep Kit(Vazyme #TR501-TR503),可(kě)快(kuài)速高(gāo)效建庫,爲mNGS的(de)快(kuài)速檢測提供新方案。該産品采用(yòng)新型的(de)轉座酶法對(duì)RNA/cDNA雜(zá)合鏈片段化(huà),将繁瑣的(de)RNA片段化(huà)、二鏈合成、末端修複、dA-Tailing和(hé)接頭連接等步驟轉變爲一步簡單的(de)酶促反應。
圖4. TruePrep RNA Library Prep Kit建庫流程與常規試劑盒流程對(duì)比
◆ 建庫耗時(shí)短:超快(kuài)速的(de)RNA建庫流程,建庫時(shí)長(cháng)縮短至2h
◆ 微生物(wù)檢出靈敏度高(gāo):可(kě)檢出低至0.01%占比的(de)微生物(wù)
◆ 嚴格的(de)背景菌質控:低背景菌殘留
【 訂購(gòu)信息 】
Sau1:Staphyloccocus Aureus,金黃(huáng)色葡萄球菌;
PEDV2:Porcine epidemic diarrhea virus,豬流行性腹瀉病毒;
PRRSV3:Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,豬繁殖與呼吸綜合征病毒。