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真邁生物(wù):全平台實現“甲基化(huà)0%平衡文庫摻入”高(gāo)質量測序
時(shí)間:
2023-12-29
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全基因組甲基化(huà)測序文庫(WGBS)的(de)堿基比例嚴重失衡(GC%~20%),這(zhè)給高(gāo)質量的(de)測序數據交付帶來(lái)了(le)極大(dà)的(de)挑戰。通(tōng)常,我們采用(yòng)摻入高(gāo)比例的(de)專用(yòng)平衡文庫(例如PhiX文庫、E.coli文庫)或與GC含量40%~50%的(de)其他(tā)應用(yòng)樣本Pooling測序的(de)方法來(lái)緩解失衡,提高(gāo)測序質量。然而,這(zhè)種方法不僅降低了(le)生産效率,還(hái)增加了(le)測序的(de)成本和(hé)操作的(de)複雜(zá)性。


真邁生物(wù)高(gāo)通(tōng)量基因測序儀全系産品已實現“甲基化(huà)0%平衡文庫摻入”高(gāo)質量測序。本次測試中,在0% PhiX平衡文庫摻入的(de)條件下(xià),Q30均值≥92%、單index測序數據拆分(fēn)率均值≥98%,與跟堿基平衡文庫混合測序的(de)NovaSeq 6000平台數據表現相當。


【測試方案】

真邁生物(wù):全平台實現“甲基化(huà)0%平衡文庫摻入”高(gāo)質量測序


【測試結果】

(1)Q30均值達92%以上、單index 測序數據拆分(fēn)率均值達98%以上

真邁生物(wù):全平台實現“甲基化(huà)0%平衡文庫摻入”高(gāo)質量測序

圖1A. FASTASeq 300_0% PhiX重複測序表現


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圖1B. GenoLab M_0% PhiX重複測序表現


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圖1C. SURFSeq 5000_0% PhiX重複測序表現


(2)數據比對(duì)表現優異,達80%以上

真邁生物(wù):全平台實現“甲基化(huà)0%平衡文庫摻入”高(gāo)質量測序

圖2A. FASTASeq 300和(hé)GenoLab M平台重複測序的(de)Mapping Rate


真邁生物(wù):全平台實現“甲基化(huà)0%平衡文庫摻入”高(gāo)質量測序

圖2B. SURFSeq 5000重複測序的(de)Mapping Rate



(3)甲基化(huà)類型和(hé)分(fēn)布水(shuǐ)平表現均高(gāo)度一緻

真邁生物(wù):全平台實現“甲基化(huà)0%平衡文庫摻入”高(gāo)質量測序

圖3A. 不同甲基化(huà)類型的(de)比例


真邁生物(wù):全平台實現“甲基化(huà)0%平衡文庫摻入”高(gāo)質量測序

圖3B. 全基因組CG位點甲基化(huà)水(shuǐ)平分(fēn)布


真邁生物(wù)通(tōng)過技術優化(huà)升級,全系産品實現了(le)“甲基化(huà)0%平衡文庫摻入”高(gāo)質量測序。這(zhè)一技術突破,進一步增強了(le)真邁生物(wù)測序儀的(de)産品力,爲廣大(dà)用(yòng)戶提供更爲高(gāo)效、經濟的(de)測序平台工具。


【真邁生物(wù)高(gāo)通(tōng)量測序儀産品介紹】

真邁生物(wù):全平台實現“甲基化(huà)0%平衡文庫摻入”高(gāo)質量測序


真邁生物(wù):全平台實現“甲基化(huà)0%平衡文庫摻入”高(gāo)質量測序

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撰稿:崔青美(měi)

編輯:市場(chǎng)部

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